产品组分
产品货号
|
规格
|
价格
|
MI0019A
|
1ml
|
80元
|
MI0019B
|
5*1ML
|
200元
|
1.简介
Taq DNA聚合酶是一种热稳定酶,在适合的体系,特定引物和dNTPs存在的情况下,可以根据已解链的模板合成DNA。我们的产品Taq DNA Polymerase是一种重组酶,分子量约为94kd。
Taq DNA聚合酶具有5'→3'DNA聚合酶和微弱的5'→3'核酸外切酶的能力,但没有3'→5'外切酶的能力,这意味着在3'末端会出现dA突出。利用该特征,可以将dA添加到平端的3'末端,用于TA克隆。在PCR反应中,对于大多数模板,Taq DNA聚合酶的延伸速度通常为1kb/min,对于高复杂性的基因,它可能需要1-2kb/min。
该Master Mix含有染料,这意味着它可以在扩增后直接进行电泳,无需添加上样缓冲液。
如果模板具有更多的二级结构,更高的GC含量或是长度超过5 kb,您可能需要更多优化。
2.配置PCR反应体系
如下表配置您的PCR反应体系,或使用您自己的体系和条件。
完全解冻Master Mix和各个组分,在使用前混合并短暂离心。我们建议在冰上配置所有反应组分。
Compent
|
20μl reaction
|
50μl reaction
|
Final concentration
|
ddH2O
|
Add to 20μl
|
Add to 50μl
|
/
|
10μM forward primer
|
0.8μl
|
2μl
|
0.4μM
|
10μM reverse primer
|
0.8μl
|
2μl
|
0.4μM
|
Template DNA
|
varies
|
varies
|
1-500ng
|
2X Taq PCR Master Mix(with dye)
|
10μl
|
25μl
|
1X
|
注意点:
a.模板可以是cDNA,gDNA或λDNA。
b.Taq DNA聚合酶的最终浓度为1U/50μl反应体系。
将反应管混合并短暂离心。立即转移到PCR仪。
3.PCR循环条件
在PCR仪中进行反应。
|
Temperature
|
Time
|
cycles
|
Initial denaturation
|
94 ℃
|
3min
|
1
|
Denaturation
|
94 ℃
|
30 s
|
25-35 cycles( 可变 )
|
Annealing
|
~55 ℃(请根据您自身引物的 Tm 设置)
|
30 s
|
Extension
|
72 ℃
|
1 min/kb
|
Final extension
|
72 ℃
|
5min
|
1
|
Hold
|
4 ℃
|
+∞
|
1
|
注意点:
a.您可以使用从Tm减去3-5度(两个Tm中较低的一个)的退火温度。以下是简略的计算公式:
当引物短于20bp时,Tm(℃)=4(G+C)+2(A+T)。
当引物长于20bp时,Tm(℃)=81.5+0.41*(GC的%)-(675/长度)
您也可以使用温度梯度来确定退火温度。
对于一些高度复杂的基因组DNA或cDNA模板,延伸时间可以增加到每kb 90秒。
4.电泳
该Master Mix含有染料,可在PCR结束后直接进行电泳,无需添加上样缓冲液。如果您需要对PCR产物进行琼脂糖凝胶电泳,可以使用我们的产品SYBR Safe DNA Gel Stain。您可以将PCR产品立即用于下游应用,或将其储存在-20°C。
5.注意点
5.1.PCR反应应在无杂质DNA污染的环境中进行。建议使用“干净”的专用自动移液枪和喷雾阻挡枪头。始终保持阳性/阴性对照DNA或其他模板与其他组分分开。使用的PCR管应当不含核酸酶。
5.2.常用的寡核苷酸引物长度通常为20-40个核苷酸,最好具有约40-60%的GC含量。反应中每种引物的最终浓度可以是在0.05-1μM范围中间,通常是0.1-0.5μM。
5.3.可以使用添加剂(例如DMSO或甲酰胺)改善一些难以扩增的模板的反应体系,如富含GC的序列。
5.4.对于难以扩增的模板,例如富含GC的序列,建议在PCR循环之前进行更长的初始变性,例如在95°C下5分钟,以使模板完全变性。如使用菌落PCR,建议在95°C下进行最初5分钟变性。
5.5.退火时间可在15-60秒之间。退火温度常基于引物的Tm,通常为45-72℃。退火温度可以通过进行温度梯度PCR来优化,例如,比计算的Tm低5°C开始设置梯度。
5.6.建议的延伸温度为72°C。对于大多数模板,延伸时间通常为每kb 1分钟。
5.7.通常,25-35个循环能够产生足够的产物。检测低拷贝数的模板可能需要多达45个循环。
请注意,太多的循环会导致非特异性条带增多。
5.8.当退火温度高于72°C时,建议采用两步法。
|
Temperature
|
Time
|
Cycles
|
Initial denaturation
|
94℃
|
3min
|
1
|
Denaturation
|
94℃
|
30 s
|
variable
|
Extension
|
72℃
|
1 min/kb
|
Final extension
|
72℃
|
5min
|
1
|
Hold
|
4℃
|
+∞
|
1
|
5.9.Taq DNA聚合酶产生的PCR产物在3'端含有dA突出;因此,PCR产物可以连接到dT/dU-突出的载体上。