产品及特点
本试剂盒适合于从新鲜或冷冻的动物组织,细胞,血液,细菌等多种样品中提取高纯度总DNA。本品可纯化获得分子量最大为50kb的DNA片段,纯化过程不需要使用苯酚或氯仿等有毒溶剂,无需乙醇沉淀。本试剂盒采用优化的缓冲体系使裂解液中的DNA高效特异的结合到硅基质离心吸附柱上,PCR和其他酶促反应的抑制剂可通过两步洗涤步骤被有效去除,最后使用低盐缓冲液或水洗脱,即可得到高纯度DNA。纯化得到的DNA可以直接用于酶切,PCR,Real-Time PCR,文库构建,Southern Blot,它具有下列特点:
1.简便快速:1小时内可获得高纯度的基因组DNA;
2.质量好:可直接进行PCR、酶切和杂交等分子生物学实验。
成分规格
产品组成
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MI010403-50
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MI010403-100
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MI010403-200
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Buffer GTL
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12 ml
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25 ml
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50 ml
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Buffer GL
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12 ml
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25 ml
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50 ml
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Buffer W1(concentrate)
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13 ml
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26 ml
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52 ml
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Buffer W2(concentrate)
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15 ml
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30 ml
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60 ml
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Buffer EB
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10 ml
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10 ml
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30 ml
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Proteinase K
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1 ml
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2×1 ml
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4×1 ml
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Spin Column with Collection Tubes
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50套
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100套
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200套
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保存条件
蛋白酶K于-20℃,其他组分室温(15-30℃)。
使用方法
【自备试剂】
无水乙醇
Enzymatic Lysis Buffer(提取革兰氏阳性菌基因组DNA时须准备)。Enzymatic Lysis Buffer配方:20 mM Tris,pH 8.0;2 mM Na2-EDTA;1.2%Triton X-100;终浓度为20mg/ml的Lysozyme(溶菌酶)。
一、血液及细胞样本基因组提取
1.材料处理
1)如果提取材料为哺乳动物抗凝血液(无核红细胞),可直接向50-200μl新鲜或冷冻的抗凝血液样品中加入Buffer GTL补足至200μl。
2)如果提取材料为禽类,鸟类,两栖类或更低级生物的抗凝血液,其红细胞为有核细胞,取5-10μl新鲜或冷冻的抗凝血液样品,加入Buffer GTL补足至200μl。
3)贴壁培养的细胞应先处理为细胞悬液(最大提取量为5x106个细胞),2000 rpm(400g)离心5min,弃尽上清,加200μl GTL,振荡至样品彻底悬浮。
(注意:如需去除RNA,可在上述步骤完成后,加入4μl浓度为100mg/ml的RNase A溶液,涡旋15秒,室温放置2min。)
2.加入20μl Proteinase K溶液,混匀。
3.加入200μl Buffer GL,涡旋振荡充分混匀,56˚C水浴10min。
4.短暂离心以去除管盖内壁的水珠。加入200μl无水乙醇,涡旋振荡充分混匀,短暂离心。
(注意:加入Buffer GL和无水乙醇后要立即涡旋震荡混匀。加入Buffer GL和无水乙醇后可能会产生白色沉淀,不会影响后续实验。一些组织在加入Buffer GL和无水乙醇后可能形成溶胶状产物,此时推荐进行剧烈震荡或涡旋处理。)
5.上一个步骤中所得溶液全部加入到已装入收集管的吸附柱(Spin Columns DM)中,若一次不能加完溶液,可分多次转入。12,000 rpm(约13,400g)离心1min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
6.向吸附柱中加入500μl Buffer W1(使用前检查是否已加入无水乙醇),12,000 rpm离心1min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
7.向吸附柱中加入500μl Buffer W2(使用前检查是否已加入无水乙醇),12,000 rpm离心1min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
(注意:如需进一步提高DNA纯度,可重复步骤7。)
8.12,000 rpm离心2min,倒掉收集管中废液。将吸附柱置于室温数分钟,以彻底晾干。
(注意:这一步的目的是将吸附柱中残余的乙醇去除,乙醇的残留会影响后续的酶切、PCR等酶促反应)。
9.将吸附柱置于一个新的离心管(自备)中,向吸附柱的中间部位悬空加入50-200μl Buffer EB或灭菌水,室温放置2-5min,12000rpm离心1min,收集DNA溶液,-20℃保存DNA。
(注意:为增加洗脱效率,可将洗脱液Buffer EB在60℃预热。如需使用去离子水洗脱,可用NaOH调整其pH值在7.0-8.5之间,为了增加回收率,可将得到的溶液重新加入到吸附柱中,室温放置2 min,再次离心收集)
二、动物组织基因组提取
1.材料处理
如果提取材料为动物组织,取25 mg(脾组织用量应少于10 mg);如果材料为鼠尾,取一段长度为0.4-0.6 cm的大鼠鼠尾或两段长度为0.4-0.6 cm的小鼠鼠尾。样本进行液氮研磨或切成小块后置于1.5 ml离心管中,加入180μl Buffer GTL,将不同样品做好标记。若使用匀浆器处理样本,匀浆前向样本中加入不超过80μl Buffer GTL,匀浆后加入100μl Buffer GTL。
(注意:1)确保各组织的量不要超出推荐范围。2)组织样本在加入Buffer GTL之前用液氮研磨或加入Buffer GTL用匀浆器匀浆处理,可以增加裂解效率。)
2.加入20μl Proteinase K,涡旋震荡使样品彻底混匀。56℃水浴,直至组织完全裂解,孵育过程中可每隔一段时间颠倒或震荡离心管使样品分散。
(注意:1)不同组织消化时间不同,通常1-3小时即可完成,鼠尾需要消化6-8小时,必要时过夜消化,不会影响后续操作。2)如果孵育和涡旋震荡后仍然有胶状物质,延长56˚C孵育时间或再加入20μl Proteinase K消化。3)如需去除RNA,可在上述步骤完成后,加入4μl的浓度为100mg/ml的RNase A溶液,涡旋15秒,室温放置5-10min。)
3.加入200μl Buffer GL,涡旋震荡充分混匀,70˚C水浴10min。短暂离心后加入200μl无水乙醇,涡旋震荡充分混匀。
(注意:1)加入Buffer GL和无水乙醇后要立即涡旋震荡混匀。
2)加入Buffer GL和无水乙醇后可能会产生白色沉淀,不会影响后续实验。一些组织(如脾,肺)在加入Buffer GL和无水乙醇后可能形成溶胶状产物,此时推荐进行剧烈震荡或涡旋处理。)
4.短暂离心,将步骤3所得溶液全部加入到已装入收集管的吸附柱(Spin Columns DM)中,若一次不能加完溶液,可分多次转入。12,000 rpm(约13,400g)离心1min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
5.向吸附柱中加入500μl Buffer W1(使用前检查是否已加入无水乙醇),12,000 rpm离心1 min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
6.向吸附柱中加入500μl Buffer W2(使用前检查是否已加入无水乙醇),12,000 rpm。离心1min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
(注意:如需进一步提高DNA纯度,可重复步骤6。)
7.12,000 rpm离心2min,倒掉收集管中废液。将吸附柱置于室温数分钟,以彻底晾干。
(注意:这一步的目的是将吸附柱中残余的乙醇去除,乙醇的残留会影响后续的酶切,PCR等酶促反应)。
8.将吸附柱置于一个新的离心管(自备)中,向吸附柱的中间部位悬空加入50-200μl Buffer EB或灭菌水,室温放置2-5min,12,000 rpm离心1min,收集DNA溶液,-20℃保存DNA。
(注意:为增加洗脱效率,可将洗脱液Buffer EB在60℃预热。如需使用去离子水洗脱,可用NaOH调整其pH值在7.0-8.5之间,为了增加回收率,可将得到的溶液重新加入到吸附柱中,室温放置2 min,再次离心收集)
三、细菌基因组提取
1.细菌样本预处理
取1-3 ml过夜培养的菌液,室温10,000 rpm离心1 min,弃上清。
(注意:根据菌液的浓度决定取液量,当OD600=1时,1ml菌液浓度为109个细胞,菌液的量不要超过109个细胞,太多会使离心柱的膜堵塞,提取的基因组DNA的量减少,纯度降低)
2.加入200μl Buffer GTL,用枪头充分吹打或用涡旋振荡器充分悬浮。
(注意:对于较难破壁的革兰氏阳性菌,可略过第2步骤,加入溶菌酶进行破壁处理,具体方法为:加入180µl终浓度为20 mg/ml的溶菌酶缓冲液(20 mM Tris,pH 8.0;2 mM Na2-EDTA;1.2%Triton X-100;溶菌酶必须用溶菌酶干粉溶解在缓冲液中进行配制,否则会导致溶菌酶无活性),37℃处理30 min以上。如要去除RNA,可加入浓度为100 mg/ml的RNase A 4μl,室温处理5 min)
3.加入20μl Proteinase K溶液,充分混匀。
4.加入200μl Buffer GL,充分混匀,56℃水浴10 min,孵育过程中每隔一段时间颠倒或震荡离心管使样本分散均匀。溶液变得清亮后短暂离心,以去除管盖内壁的水珠。
(注意:Buffer GL加入时可能会产生白色沉淀,一般56℃时会消失,不影响后续实验,如溶液未变清亮,说明细胞裂解不彻底,可能导致提取的DNA量少或者提取的DNA不纯)
5.加入200μl无水乙醇,充分震荡,此时可能会出现絮状沉淀,短暂离心以去除管盖内壁水珠。
6.将一个离心吸附柱放入收集管中,将上一步所得溶液和絮状沉淀转移到吸附柱中,12,000 rpm离心1 min,弃收集管中的滤液。
7.向吸附柱中加入500μl Buffer W1(使用前检查是否已加入无水乙醇),12,000 rpm离心1min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
8.向吸附柱中加入500μl Buffer W2(使用前检查是否已加入无水乙醇),12,000 rpm。离心1min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
(注意:如需进一步提高DNA纯度,可重复步骤6。)
9.12,000 rpm离心2min,倒掉收集管中废液。将吸附柱置于室温数分钟,以彻底晾干。
(注意:这一步的目的是将吸附柱中残余的乙醇去除,乙醇的残留会影响后续的酶切、PCR等酶促反应)。
10.将离心吸附柱置于一个新的1.5 ml塑料离心管(自备)中,加入50-100μl Buffer EB,室温放置2 min,12,000 rpm离心1 min,离心管底溶液即基因组DNA。
(注意:为增加洗脱效率,可将洗脱液Buffer EB在60℃预热。如需使用去离子水洗脱,可用NaOH调整其pH值在7.0-8.5之间,为了增加回收率,可将得到的溶液重新加入到吸附柱中,室温放置2 min,再次离心收集)
注意事项
如Buffer GTL和Buffer GL产生沉淀,可在56℃水浴溶解;
样品应避免反复冻融,否则会导致提取的DNA片段小,提取量下降;
所有离心步骤均为台式离心机,室温下操作;
按要求在Buffer W1和Buffer W2中加入无水乙醇。